Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSEN34Q9BSV6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSEN34Q9BSV6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms