Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms