Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
KRT28Q7Z3Y7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms