Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC9Q6ZRR7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms