Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A3Q6PIS1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC23A3Q6PIS1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms