Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC181Q5TID7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC181Q5TID7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms