Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3KQ59H18 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms