Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD1Q15797 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD1Q15797 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms