Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB35Q15286 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms