Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN1Q14699 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN1Q14699 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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