Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4AQ13619 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4AQ13619 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
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