Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBA1Q02410 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms