Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms