Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERV-K104P61576 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms