Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GARSP41250 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GARSP41250 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GARSP41250 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GARSP41250 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GARSP41250 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GARSP41250 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GARSP41250 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GARSP41250 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GARSP41250 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARSP41250 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARSP41250 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms