Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPGDP15428 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPGDP15428 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HPGDP15428 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HPGDP15428 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms