Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1P11940 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1P11940 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms