Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB1P08034 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB1P08034 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB1P08034 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB1P08034 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms