Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2P04141 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2P04141 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2P04141 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2P04141 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2P04141 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2P04141 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF2P04141 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF2P04141 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF2P04141 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF2P04141 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2P04141 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF2P04141 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF2P04141 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF2P04141 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms