Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCA5LO95447 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms