Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAD1O00515 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAD1O00515 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAD1O00515 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAD1O00515 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAD1O00515 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAD1O00515 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAD1O00515 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAD1O00515 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAD1O00515 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAD1O00515 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAD1O00515 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAD1O00515 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAD1O00515 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAD1O00515 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAD1O00515 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAD1O00515 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAD1O00515 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAD1O00515 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAD1O00515 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAD1O00515 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAD1O00515 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms