Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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