Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLXND1Q9Y4D7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms