Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms