Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UPF3BQ9BZI7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UPF3BQ9BZI7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms