Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS25Q9BRG1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS25Q9BRG1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms