Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRIPQ8WXE1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms