Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVL7

ANKRD49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49Q8WVL7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ANKRD49Q8WVL7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD49Q8WVL7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms