Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL3Q8N8U3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL3Q8N8U3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms