Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHLDB3Q6NSJ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms