Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3KQ59H18 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI3KQ59H18 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms