Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3C1V9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3C1V9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3C1V9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3C1V9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3C1V9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3C1V9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3C1V9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3C1V9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3C1V9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3C1V9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3C1V9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3C1V9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3C1V9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3C1V9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3C1V9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3C1V9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3C1V9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3C1V9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3C1V9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3C1V9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3C1V9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3C1V9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3C1V9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3C1V9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3C1V9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3C1V9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3C1V9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3C1V9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3C1V9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms