Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRKQ15262 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
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PTPRKQ15262 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
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PTPRKQ15262 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRKQ15262 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
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PTPRKQ15262 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
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PTPRKQ15262 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
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PTPRKQ15262 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
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PTPRKQ15262 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
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PTPRKQ15262 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRKQ15262 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
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