Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CUL4AQ13619 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4AQ13619 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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