Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSPB3Q12988 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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