Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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NFIAQ12857 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIAQ12857 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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