Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAX2Q02962 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms