Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLOD1Q02809 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms