Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GNB1P62873 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB1P62873 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB1P62873 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNB1P62873 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNB1P62873 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB1P62873 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms