Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFB4P59827 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFB4P59827 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFB4P59827 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms