Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00205P59089 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms