Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms