Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GARSP41250 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GARSP41250 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GARSP41250 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GARSP41250 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GARSP41250 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GARSP41250 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GARSP41250 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GARSP41250 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GARSP41250 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GARSP41250 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GARSP41250 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GARSP41250 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARSP41250 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GARSP41250 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARSP41250 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GARSP41250 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GARSP41250 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GARSP41250 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GARSP41250 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GARSP41250 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.6 ms