Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ITGAEP38570 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms