Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH5P33151 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH5P33151 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH5P33151 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH5P33151 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH5P33151 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH5P33151 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms