Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGA1P17096 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGA1P17096 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGA1P17096 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms