Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL2P13500 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL2P13500 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL2P13500 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL2P13500 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL2P13500 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL2P13500 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL2P13500 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL2P13500 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL2P13500 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL2P13500 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL2P13500 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL2P13500 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL2P13500 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL2P13500 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL2P13500 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL2P13500 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms