Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT3O95395 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT3O95395 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT3O95395 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms