Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARID3CA6NKF2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARID3CA6NKF2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms