Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms